PCR dans l'analyse de l'ADN
Les services de police, les procureurs et les laboratoires criminels du monde entier ont utilisé la puissance de la réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour aider à enquêter sur les scènes de crime. La PCR aide à créer des profils d'ADN, qui servent de"code à barre" unique à chaque individu, ce qui en fait l'un des grands exemples où la biologie et la technologie fusionnent pour résoudre des problèmes sociaux.
EN QUOI SOMMES-NOUS DIFFÉRENTS ?
À la fin du projet du génome humain, il a été déterminé que le génome est composé d'environ 3 millions de bases. Parmi ceux-ci, environ 99,5 % sont identiques chez tous les humains, ce qui implique que nous ne sommes pas si différents après tout.
La variation que nous observons et qui rend chacun de nous unique se révèle être principalement due aux différences dans le nombre de séquences répétées pour des régions particulières du génome. Parmi ces régions, la répétition en tandem courte (STR) a été identifiée et est la répétition la plus couramment utilisée (utilisant 13 loci ou régions) en application aujourd'hui.
PROFILAGE ADN PAR STR
STR est composé de 3 à 4 bases nucléotidiques répétées trouvées dans différents loci du génome humain. Chaque individu hérite de deux copies, ou allèles, de ses parents, par conséquent, un profil STR pourrait être construit.
Pour différentes populations, plusieurs loci ont été utilisés comme standard dans l'identification des individus. Pour faire correspondre les profils STR, les numéros de répétition pour chaque allèle doivent être les mêmes. Par exemple, au locus D3S1358 (voir Figure 1), si l'échantillon obtenu a un profil STR à ce locus de 7,5, alors le suspect B est déjà exclu pour correspondre à l'échantillon obtenu. Si les profils d'allèles correspondent, la probabilité est calculée en fonction de la fréquence de l'allèle pour l'emplacement particulier. Cela implique que le suspect n'est pas automatiquement la source définitive de l'échantillon lorsque les profils STR correspondent.
Des bases de données ont également été créées pour faciliter le processus d'enquête, comme le Combined DNA Index System (CODIS), géré par le FBI américain.
FLUX DE PROFILAGE PCR IN STR
1. Les enquêtes commencent par la collecte de matériaux biologiques tels que les dents, les cheveux, les os et les fluides de la scène du crime.
2. Les échantillons sont ensuite transférés au laboratoire médico-légal pour un traitement ultérieur où l'ADN est extrait des échantillons (~ 1 ng d'échantillon est suffisant pour la PCR).
3. Les loci STR spécifiques sont ciblés et amplifiés par PCR. Les fragments de PCR sont ensuite analysés par séquençage ou électrophorèse.
4. Les profils STR sont ensuite générés et, s'ils sont disponibles, vérifiés avec des profils ou des bases de données suspects.
Le profilage STR nécessite des thermocycleurs robustes pour faciliter le processus d'investigation. Des résultats fiables sont nécessaires à partir des expérimentations en laboratoire humide pour aider les services de police et les procureurs à rédiger leurs rapports. Esco Lifesciences propose des thermocycleurs avec d'excellents taux de chauffage et de refroidissement, une température précise et uniforme pour garantir des profils STR fiables.